Disenyo sa laraw ug solusyon sa polypeptide peptide chain

I. Katingbanan
Ang mga peptide maoy mga espesyal nga macromolecules nga ang ilang pagkasunodsunod talagsaon sa ilang kemikal ug pisikal nga mga bahin.Ang ubang mga peptide lisud i-synthesize, samtang ang uban sayon ​​​​nga i-synthesize apan lisud limpyohan.Ang praktikal nga problema mao nga kadaghanan sa mga peptide gamay nga matunaw sa tubigon nga mga solusyon, mao nga sa atong pagputli, ang katugbang nga bahin sa hydrophobic peptide kinahanglan nga matunaw sa dili tubig nga mga solvent, Busa, kini nga mga solvent o buffers lagmit nga grabe nga dili mahiuyon sa paggamit. sa mga pamaagi sa eksperimento sa biyolohikal, aron ang mga teknisyan hugot nga gidid-an sa paggamit sa peptide alang sa ilang kaugalingon nga mga katuyoan, aron ang mga mosunod mao ang pipila ka mga aspeto sa disenyo sa mga peptide alang sa mga tigdukiduki.

Disenyo sa laraw ug solusyon sa polypeptide peptide chain
Ikaduha, ang husto nga pagpili sa sintetikong lisud nga mga peptide
1. Kinatibuk-ang gitas-on sa down-regulated sequences
Ang mga peptide nga wala’y 15 nga nahabilin labi ka dali nga makuha tungod kay ang gidak-on sa peptide nagdugang ug ang kaputli sa produkto nga krudo mikunhod.Ingon nga ang kinatibuk-ang gitas-on sa kadena sa peptide nagdugang lapas sa 20 nga nahabilin, ang tukma nga gidaghanon sa produkto usa ka hinungdanon nga kabalaka.Sa daghang mga eksperimento, dali nga makakuha og wala damha nga mga epekto pinaagi sa pagpaubos sa nahabilin nga numero sa ubos sa 20.
2. Pagpakunhod sa gidaghanon sa mga hydrophobic residues
Ang mga peptide nga adunay dako nga predominance sa hydrophobic residues, ilabi na sa rehiyon 7-12 residues gikan sa C-terminus, kasagarang hinungdan sa sintetikong mga kalisdanan.Nakita kini nga dili igo nga kombinasyon tungod kay ang usa ka B-fold sheet nakuha sa synthesis."Sa ingon nga mga kaso, mahimo’g mapuslanon ang pag-convert sa labaw sa duha nga positibo ug negatibo nga nahabilin, o ibutang ang Gly o Pro sa peptide aron maablihan ang komposisyon sa peptide."
3. Pag-downregulation sa "lisud" nga mga salin
"Adunay daghang mga Cys, Met, Arg, ug Try residues nga kasagaran dili dali nga ma-synthesize."Ang Ser kasagarang gamiton isip nonoxidative nga alternatibo sa Cys.
Disenyo sa laraw ug solusyon sa polypeptide peptide chain

Ikatulo, pagpalambo sa husto nga pagpili sa matunaw sa tubig
1. I-adjust ang N o C terminal
May kalabotan sa acidic peptides (nga mao, negatibo nga gikarga sa pH 7), ang acetylation (N-terminus acetylation, C terminal kanunay nga nagmintinar sa usa ka libre nga grupo sa carboxyl) labi nga girekomenda aron madugangan ang negatibo nga bayad.Bisan pa, alang sa sukaranan nga mga peptide (nga mao, positibo nga gikarga sa pH 7), ang amination (libre nga grupo sa amino sa N-terminus ug amination sa C-terminus) labi nga girekomenda aron madugangan ang positibo nga bayad.

2. Gipamub-an o gipalugwayan pag-ayo ang han-ay

Ang pipila sa mga han-ay naglangkob sa usa ka dako nga gidaghanon sa mga hydrophobic amino acids, sama sa Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ug Ala, ug uban pa.Mahimong mapuslanon ang pagpalugway sa pagkasunod-sunod aron madugangan pa ang positibo ug negatibo nga mga poste sa peptide.Ang ikaduha nga kapilian mao ang pagpaubos sa gidak-on sa kadena sa peptide aron madugangan ang positibo ug negatibo nga mga poste pinaagi sa pagpaubos sa mga residu sa hydrophobic.Ang mas lig-on nga positibo ug negatibo nga mga bahin sa peptide chain, mas lagmit nga kini mo-reaksyon sa tubig.
3. Ibutang sa usa ka tubig-matunaw salin
Alang sa pipila nga mga kadena sa peptide, ang kombinasyon sa pipila nga positibo ug negatibo nga mga amino acid makapauswag sa pagkatunaw sa tubig.Girekomenda sa among kompanya ang N-terminus o C-terminus sa acidic peptides nga isagol sa Glu-Glu.Ang N o C nga terminus sa batakang peptide gihatag ug dayon Lys-Lys.Kung dili mabutang ang gisakyan nga grupo, mahimo usab nga ibutang ang Ser-Gly-Ser sa N o C terminal.Bisan pa, kini nga pamaagi dili molihok kung ang mga kilid sa kadena sa peptide dili mabag-o.